Adapun tujuan didirikannya UPT. Laboratorium Kesmavet adalah untuk:
1. Melayani permintaan pengujian bahan asal hewan dari customer (pelanggan).
2. Melakukan monitoring dan surveilans terhadap tingkat cemaran mikroba, residu antibiotika, formalin, boraks dll.
3. Melakukan monitoring terhadap pemalsuan/pencampuran produk hewan dengan bahan yang tidak halal seperti daging babi, dan dari daging bangkai/ayam tiren
4. Mengembangkan kemampuan laboratorium untuk melaksanakan jenis pengujian lainnya yang menjadi kebutuhan masyarakat dimasa yang akan datang.
5. Mengembangkan inovasi pelayanan yang akan bermanfaat bagi masyarakat terkait pengujian yang dilakukan Lab. Kesmavet.